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科研人員首繪小黃魚全基因組精細圖譜

2022-11-20 10:20 來源:環(huán)球網(wǎng) 閱讀數(shù):832

17日,記者從浙江省農(nóng)科院獲悉,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作,首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術手段,相關研究論文近日在線發(fā)表于學術期刊《分子生態(tài)學資源》上。

小黃魚是中國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟魚,味道鮮美,廣受青睞。2021年,浙江省農(nóng)科院等單位通過連續(xù)8年產(chǎn)學研聯(lián)合攻關,突破了野生小黃魚馴活、人工催產(chǎn)和全人工規(guī)?;庇P鍵技術,實現(xiàn)小黃魚網(wǎng)箱養(yǎng)殖規(guī)?;a(chǎn)。隨著小黃魚全養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的擴大和科研的深入,破譯小黃魚基因組,發(fā)掘生長、性別決定等相關重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題。

“黃魚屬擁有東海四大海產(chǎn)中的小黃魚與大黃魚兩個重要經(jīng)濟魚類,雖然它們形態(tài)和染色體核型相似,但是黃魚屬物種之間的遺傳關系尚未明確?!闭撐牡谝蛔髡摺⒄憬∞r(nóng)科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹,本研究通過結(jié)合四類基因組測序技術,構(gòu)建了小黃魚染色體水平的基因組精細圖譜;揭示小黃魚基因組大小為706 Mb,注釋基因為25233個;進化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關系最近,大概在2540萬年前開始分化。

謝慶平介紹,魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向,在學術界仍然是一個有待解決的有趣謎團。此次研究通過轉(zhuǎn)錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術方法,鑒定出dmrt1基因為小黃魚的雄性特異性基因,且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現(xiàn)象產(chǎn)生的生物標記。

論文通訊作者、浙江省農(nóng)科院水生所所長樓寶研究員表示,小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪制,對于海洋漁業(yè)資源保護、小黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術的研究意義重大,可以為科研人員開展小黃魚種質(zhì)資源挖掘保護、經(jīng)濟性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎的輔助育種平臺。

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